Protein–RNA interactions for Protein: Q96J02

ITCH, E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITCHQ96J02 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ITCHQ96J02 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITCHQ96J02 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITCHQ96J02 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms