Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEC22AQ96IW7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC22AQ96IW7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms