Protein–RNA interactions for Protein: Q96IR7

HPDL, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPDLQ96IR7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HPDLQ96IR7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPDLQ96IR7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms