Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SUCLG2Q96I99 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SUCLG2Q96I99 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SUCLG2Q96I99 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms