Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCARF2Q96GP6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARF2Q96GP6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARF2Q96GP6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms