Protein–RNA interactions for Protein: Q96FF7

MISP3, Uncharacterized protein MISP3, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MISP3Q96FF7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MISP3Q96FF7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MISP3Q96FF7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms