Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO1Q96FE5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms