Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC51Q96ER9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC51Q96ER9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms