Protein–RNA interactions for Protein: Q96EN9

C19orf60, Uncharacterized protein C19orf60, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf60Q96EN9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf60Q96EN9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C19orf60Q96EN9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms