Protein–RNA interactions for Protein: Q96EC8

YIPF6, Protein YIPF6, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF6Q96EC8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
YIPF6Q96EC8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
YIPF6Q96EC8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms