Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ELP4Q96EB1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ELP4Q96EB1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ELP4Q96EB1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms