Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPDL1Q96EA4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPDL1Q96EA4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms