Protein–RNA interactions for Protein: Q96DS6

MS4A6E, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6E, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6EQ96DS6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MS4A6EQ96DS6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A6EQ96DS6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms