Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C18orf8Q96DM3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C18orf8Q96DM3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms