Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHISA4Q96DD7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SHISA4Q96DD7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHISA4Q96DD7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms