Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RMDN1Q96DB5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RMDN1Q96DB5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RMDN1Q96DB5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms