Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RNF183Q96D59 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF183Q96D59 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms