Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX3

ZNF501, Zinc finger protein 501, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF501Q96CX3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZNF501Q96CX3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF501Q96CX3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms