Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL29Q96CT2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL29Q96CT2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL29Q96CT2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms