Protein–RNA interactions for Protein: Q96A49

SYAP1, Synapse-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYAP1Q96A49 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SYAP1Q96A49 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYAP1Q96A49 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SYAP1Q96A49 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYAP1Q96A49 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYAP1Q96A49 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYAP1Q96A49 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYAP1Q96A49 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYAP1Q96A49 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYAP1Q96A49 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYAP1Q96A49 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYAP1Q96A49 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYAP1Q96A49 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYAP1Q96A49 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SYAP1Q96A49 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYAP1Q96A49 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYAP1Q96A49 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYAP1Q96A49 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYAP1Q96A49 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYAP1Q96A49 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYAP1Q96A49 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYAP1Q96A49 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYAP1Q96A49 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYAP1Q96A49 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SYAP1Q96A49 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYAP1Q96A49 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms