Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
UTP4Q969X6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UTP4Q969X6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms