Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP7Q93009 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP7Q93009 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP7Q93009 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP7Q93009 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP7Q93009 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP7Q93009 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP7Q93009 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP7Q93009 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP7Q93009 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP7Q93009 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP7Q93009 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP7Q93009 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP7Q93009 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP7Q93009 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP7Q93009 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP7Q93009 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP7Q93009 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP7Q93009 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP7Q93009 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP7Q93009 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP7Q93009 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP7Q93009 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP7Q93009 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP7Q93009 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP7Q93009 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP7Q93009 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP7Q93009 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP7Q93009 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP7Q93009 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP7Q93009 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP7Q93009 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP7Q93009 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP7Q93009 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP7Q93009 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP7Q93009 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP7Q93009 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP7Q93009 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP7Q93009 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP7Q93009 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP7Q93009 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP7Q93009 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP7Q93009 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP7Q93009 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP7Q93009 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP7Q93009 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP7Q93009 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP7Q93009 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP7Q93009 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP7Q93009 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP7Q93009 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP7Q93009 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP7Q93009 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP7Q93009 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP7Q93009 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP7Q93009 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP7Q93009 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP7Q93009 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP7Q93009 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP7Q93009 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP7Q93009 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP7Q93009 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP7Q93009 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP7Q93009 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP7Q93009 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP7Q93009 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP7Q93009 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP7Q93009 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP7Q93009 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP7Q93009 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP7Q93009 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP7Q93009 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP7Q93009 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP7Q93009 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP7Q93009 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP7Q93009 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP7Q93009 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP7Q93009 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP7Q93009 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP7Q93009 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP7Q93009 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP7Q93009 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP7Q93009 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP7Q93009 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP7Q93009 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP7Q93009 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP7Q93009 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP7Q93009 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP7Q93009 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP7Q93009 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP7Q93009 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP7Q93009 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP7Q93009 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP7Q93009 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP7Q93009 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP7Q93009 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP7Q93009 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP7Q93009 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP7Q93009 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP7Q93009 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms