Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PRG4Q92954 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PRG4Q92954 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PRG4Q92954 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PRG4Q92954 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PRG4Q92954 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PRG4Q92954 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PRG4Q92954 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PRG4Q92954 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms