Protein–RNA interactions for Protein: Q92529

SHC3, SHC-transforming protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC3Q92529 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHC3Q92529 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHC3Q92529 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SHC3Q92529 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHC3Q92529 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SHC3Q92529 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHC3Q92529 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SHC3Q92529 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SHC3Q92529 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHC3Q92529 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHC3Q92529 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms