Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CTTNBP2Q8WZ74 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CTTNBP2Q8WZ74 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CTTNBP2Q8WZ74 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms