Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCG3Q8WXD2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCG3Q8WXD2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms