Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CKAP2Q8WWK9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms