Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBR1Q8WVP7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMBR1Q8WVP7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.3 ms