Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NSMCE1Q8WV22 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE1Q8WV22 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms