Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUM0

NUP133, Nuclear pore complex protein Nup133, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP133Q8WUM0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP133Q8WUM0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP133Q8WUM0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP133Q8WUM0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP133Q8WUM0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP133Q8WUM0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP133Q8WUM0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP133Q8WUM0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP133Q8WUM0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP133Q8WUM0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP133Q8WUM0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP133Q8WUM0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP133Q8WUM0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP133Q8WUM0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP133Q8WUM0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP133Q8WUM0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP133Q8WUM0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP133Q8WUM0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP133Q8WUM0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP133Q8WUM0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NUP133Q8WUM0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP133Q8WUM0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms