Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TSKUQ8WUA8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TSKUQ8WUA8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms