Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELQQ8TDG4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELQQ8TDG4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms