Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEK9Q8TD19 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK9Q8TD19 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK9Q8TD19 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms