Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO3Q8TAP4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO3Q8TAP4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms