Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HJURPQ8NCD3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms