Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCB2

CAMKV, CaM kinase-like vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKVQ8NCB2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAMKVQ8NCB2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAMKVQ8NCB2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAMKVQ8NCB2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAMKVQ8NCB2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms