Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM229BQ8NBD8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM229BQ8NBD8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms