Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NME8Q8N427 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME8Q8N427 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME8Q8N427 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
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