Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPC2Q8N158 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPC2Q8N158 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms