Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z3

SPICE1, Spindle and centriole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPICE1Q8N0Z3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPICE1Q8N0Z3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPICE1Q8N0Z3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms