Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERC6Q8IVU3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms