Protein–RNA interactions for Protein: Q86X52

CHSY1, Chondroitin sulfate synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY1Q86X52 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHSY1Q86X52 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHSY1Q86X52 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms