Protein–RNA interactions for Protein: Q86UV5

USP48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP48Q86UV5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP48Q86UV5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP48Q86UV5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP48Q86UV5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.57■■■□□ 2
USP48Q86UV5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP48Q86UV5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP48Q86UV5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP48Q86UV5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP48Q86UV5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP48Q86UV5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP48Q86UV5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP48Q86UV5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USP48Q86UV5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP48Q86UV5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP48Q86UV5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.56■■■□□ 2
USP48Q86UV5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP48Q86UV5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP48Q86UV5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP48Q86UV5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP48Q86UV5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.55■■■□□ 2
USP48Q86UV5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP48Q86UV5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP48Q86UV5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP48Q86UV5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP48Q86UV5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP48Q86UV5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP48Q86UV5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP48Q86UV5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP48Q86UV5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP48Q86UV5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP48Q86UV5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.54■■■□□ 2
USP48Q86UV5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP48Q86UV5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP48Q86UV5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP48Q86UV5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP48Q86UV5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP48Q86UV5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP48Q86UV5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP48Q86UV5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms