Protein–RNA interactions for Protein: Q86UP9

LHFPL3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHFPL3Q86UP9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHFPL3Q86UP9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHFPL3Q86UP9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHFPL3Q86UP9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHFPL3Q86UP9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHFPL3Q86UP9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LHFPL3Q86UP9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHFPL3Q86UP9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHFPL3Q86UP9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHFPL3Q86UP9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHFPL3Q86UP9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHFPL3Q86UP9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHFPL3Q86UP9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHFPL3Q86UP9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHFPL3Q86UP9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHFPL3Q86UP9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHFPL3Q86UP9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHFPL3Q86UP9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHFPL3Q86UP9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHFPL3Q86UP9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LHFPL3Q86UP9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms