Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6J0

SH3RF1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF1Q7Z6J0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3RF1Q7Z6J0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3RF1Q7Z6J0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3RF1Q7Z6J0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3RF1Q7Z6J0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3RF1Q7Z6J0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3RF1Q7Z6J0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3RF1Q7Z6J0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3RF1Q7Z6J0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3RF1Q7Z6J0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3RF1Q7Z6J0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3RF1Q7Z6J0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3RF1Q7Z6J0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3RF1Q7Z6J0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SH3RF1Q7Z6J0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH3RF1Q7Z6J0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH3RF1Q7Z6J0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms