Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRGAP1Q7Z6B7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP1Q7Z6B7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms