Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX20Q7Z614 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX20Q7Z614 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX20Q7Z614 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms