Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KRT27Q7Z3Y8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KRT27Q7Z3Y8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
KRT27Q7Z3Y8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KRT27Q7Z3Y8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms