Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NUP54Q7Z3B4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP54Q7Z3B4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NUP54Q7Z3B4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms