Protein–RNA interactions for Protein: Q7LC44

ARC, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCQ7LC44 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARCQ7LC44 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ARCQ7LC44 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms